2.获得性学说 目前越来越多的动物实验和临床研究的证据表明，Barrett食管是一种获得性疾病，它与胃食管反流性疾病有密切关系。食管下段长期暴露于酸性溶液、胃酶和胆汁中，造成食管黏膜的炎症和破坏，导致耐酸的柱状上皮替代鳞状上皮。研究证实，大多数Barrett食管病人存在反流性食管炎。临床还发现，一些外科手术后，如食管肌层切开术、全胃切除加食管空肠吻合术以及胃食管侧侧吻合等手术后均可发生Barrett食管。其发生机制主要是由于手术破坏了食管下括约肌的完整性，造成胃酸和胆汁反流或食管及胃排空障碍。此外，也有报道化疗药物可使食管黏膜损伤，导致Barrett食管(表2)。
动物模型在研究Barrett食管的病因和发病机制中起了非常重要的作用。20世纪60年代末就有学者试图建立Barrett食管的动物模型，但未获成功。Bremner和Gillen等分别在先前的动物模型基础上，增加了长期高酸反流的条件，成功地建立了Barrett食管的动物模型，这一成果有力地支持Barrett食管的获得性学说。此后又有一些不同的动物模型相继出现。 3.柱状上皮的来源 关于Barrett食管柱状上皮的来源尚未定论。目前有几种看法：①来源于鳞状上皮的基底细胞；②来源于食管贲门腺体细胞；③来源于胃黏膜或原始干细胞。
1.内科治疗 为Barrett食管的首选治疗方法。无主诉症状及无并发症者，无须外科治疗，主要是改变不良生活习惯例如应减少摄入刺激性饮食，抬高床头，戒烟戒酒，忌吃抑制食管下括约肌张力的巧克力等食物，避免身体超重。药物治疗多选择H2受体拮抗剂和质子泵抑制剂，辅以促胃动力药治疗。对于Barrett溃疡：临床资料显示部分病人虽然酸分泌明显减少、溃疡愈合，但胃食管反流仍然存在，经过进一步的研究发现在Barrett食管病人，胃食管反流物不但有酸性物质，而且有碱性物质。因此人们推测，由于目前的治疗方法主要是通过改变食管和胃的pH值来减少胃食管反流症状，而不能防止碱性胃内容物反流到食管，所以药物治疗后，酸性物质引起的症状得到控制，而碱性反流持续存在，继续破坏着食管黏膜。对于大多数Barrett狭窄患者，对扩张疗法和药物治疗有良好的反应。特别是在反复扩张后，吞咽困难的症状可得到缓解。 2.手术治疗 适用于内科治疗无效、持续有症状并有并发症的病人，外科治疗的目的是抑制反流，防止柱状上皮继续发展和向上扩延。Starnes等指出，临床上仅有15%的Barrett食管病人经药物治疗后效果较好，其余的85%效果欠佳。目前多数学者主张，对Barrett食管病人，不论其有无症状，只要客观存在胃食管反流(食管pH监测阳性)，活体组织检查有肠上皮化生或任何程度的上皮异型增生，都必须进行抗反流手术，特别是那些有反流性食管炎、溃疡或狭窄的病人，必须彻底纠正反流。因此可以认为，对Barrett食管的病人，只要具备手术条件，特别是年轻患者，病史短及药物治疗效果不佳，或难以控制并发症发展的病人，应考虑行抗反流手术(表5)。
治疗Barrett食管的手术方式以Nissen胃底折叠术为首选术式。各种治疗的效果均应通过食管24h pH测定、内镜及临床表现作综合评价。此外，手术后仍应定期行内镜检查和活检。成功的抗反流手术后，柱状上皮可以退变，如抗反流手术后仍存在反流，无疑癌变的危险继续存在。然而成功的抗反流手术之后，仍会在柱状上皮被覆的食管上皮上发生腺癌。目前认为Barrett食管癌最有效的治疗是外科手术。凡经内镜及病理证实的Barrett食管癌应尽早实施手术。手术方法同食管癌切除术，胃肠道重建多用残胃或结肠，少数用空肠。手术死亡率为0～10%。
常见的并发症有： 1.溃疡 Barrett食管引起溃疡的发病率为2%～54%，食管柱状上皮受酸性消化液腐蚀后可以发生溃疡，出现类似胃溃疡的症状，疼痛可放射至背部，并可引起穿孔、出血、浸润、溃疡愈合后发生狭窄，出现下咽不畅的症状。甚至可穿透主动脉导致大出血而迅速致死。Barrett溃疡的病理分型有两种，最为常见的为发生在鳞状上皮段的浅表性溃疡，这种类型与因反流性食管炎引起的溃疡相似。另一种少见的为发生在柱状上皮段的深大溃疡，与消化性溃疡相似。 2.狭窄 食管狭窄是Barrett食管最常见的并发症，发生率为15%～100%。狭窄部位多于食管中上段的鳞-柱状上皮交界处，而胃食管反流引起的狭窄多位于食管下段。反流性食管炎的发生率为29%～82%。病变可单独累及柱状上皮，也可同时累及鳞状和柱状上皮。 3.恶变 Barrett食管中发生癌肿的发生率不甚确切，长期反流物进入Barrett食管可能起恶变作用。但有研究认为Barrett食管病病人施行了抗反流手术亦不能使这些柱状上皮消退，亦不减少恶变的危险性。Barrett食管的柱状上皮区内可以发生异型增生，程度可自低度到高度，有时低度异型增生不易与正常柱状上皮区别，高度异型增生与原位癌有时难予区别，并可进展至浸润癌。这些恶变的肿瘤系腺癌。须要指出的是内镜发现贲门腺癌伴有良性柱状上皮与柱状上皮异型增生为腺癌是有区别的。Barrett食管的异型增生是癌前期状况已为多数人公认。 4.胃肠道出血 可表现为呕血或便血，并伴有缺铁性贫血，发生率约为45%，其出血来源为食管炎和食管溃疡。