镜下结构与正常的脂肪组织难以区分，主要区别在于有无包膜，活检只凭一块组织，很难作出正确的诊断，必须参考大体标本的观察。肿瘤成分以大小一致的成熟的脂肪细胞为主，有时有像黄色瘤样的瘤细胞，以及或多或少不规则分布的结缔组织间质。肿瘤附近肠壁可有不同程度充血与炎细胞浸润(图2)。 
3.病理分型 根据小肠脂肪瘤的发病部位及生长方式可分为4型： (1)腔内型：此型脂肪瘤向黏膜面呈限局性生长，并突入肠腔内，部分可有蒂。此型最多见，占90%以上。因较易引起肠腔阻塞、肠套叠、出血等并发症而易发现，体积相对较小。 (2)腔外型：凡向腔外生长者均属此型。多见于自浆膜下发生的脂肪瘤，较少见，有人统计占3.2%。较小的浆膜下外生性脂肪瘤易引起肠扭转、疼痛、阻塞等症状。 (3)肠壁间型：肿瘤不向肠腔内外突出，而仅于肠壁内者，约占5.5%。此型脂肪瘤往往较小，圆形或椭圆形，较少引起症状，呈环形生长的肠壁间型脂肪瘤易引起肠腔狭窄、阻塞。 (4)混合型：以上3种情况的不同组合。此型脂肪瘤的症状因不同情况的混合而有不同的表现。
2.内镜检查 往往表现为有蒂或无蒂黏膜下隆起性病变，表面光滑或有浅表溃疡。因小肠脂肪瘤是黏膜下病变，内镜活检常为阴性。 3.B超检查 正常小肠声像图因不同节段肠管内所含内容物的不同，通常为含有气体，黏液和液体的混合型表现。充盈状态的肠壁厚度约为3.Omm，一般不大于5.0mm。疑有肠壁增厚或发现肿块者，需饮水500ml左右继续检查，每隔10～15min重复一次。小肠脂肪瘤可在B超下呈现三种声像图特征：腔内肿块型、壁内型及腔外肿块型。 4.CT检查 可判断肿瘤部位、大小等。CT影像特征：肿瘤呈均质脂肪密度影，边界清晰，注射造影后影像不增强(图4)。肠套叠时呈不均质软组织块影，呈靶形或腊肠形。 
5.MRI检查 信号特征是Tl加权图像脂肪成分为高信号，T2加权图像亦为高信号，随回波时间延长，信号强度逐渐下降。 6.选择性肠系膜动脉造影 有助于明确病变部位及病变性质，特别是在活动性出血期。只需每分钟有0.5ml的出血量即可呈现阳性结果。 7.剖腹探查 对疑有肠道肿瘤或触诊扪及肿块而各项检查未发现病灶者，可行剖腹探查以明确诊断，去除病灶。